經黨中央、國務院批準，第二輪第二批7個中央生態環境保護督察組于2020年8月30日至9月1日陸續進駐北京、天津、浙江等3個省（市）和中國鋁業集團有限公司、中國建材集團有限公司等兩家中央企業開展督察，并對國家能源局、國家林業和草原局等2個部門開展督察試點。截至9月11日，各督察組均已進入下沉工作階段。
  在下沉工作階段，各督察組將根據前一階段督察掌握的情況和聚焦的問題線索，深入基層、深入一線、深入現場，采取暗查暗訪和蹲點調查等方式開展工作。對于省（市），重點下沉地市（區）督察了解推進落實生態環境保護工作情況；對于中央企業，重點檢查了解其所屬有關企業（單位）生態環境守法情況；對于部門，重點調查了解其職能范圍內規劃、政策落實情況和發生的突出生態環境問題及其處理處置情況。
  下沉工作期間，各督察組還將針對重要問題線索開展現場勘察和調查取證，并就是否存在采取“一刀切”方式應對督察的情況開展檢查。同時，下沉工作階段還將進一步核實污染防治攻堅戰重點任務實施情況和第一輪中央生態環境保護督察整改落實情況；對生態環境保護不作為亂作為、不擔當不碰硬，以及整改落實過程中存在的形式主義和官僚主義問題，加強針對性調查核實，做到見人見事見責任。
  各督察組將牢固樹立以人民為中心的理念，繼續將推動解決群眾反映突出的生態環境問題作為重中之重，及時轉辦督辦，加強抽查核實，開展實地回訪并面對面聽取人民群眾意見，督促被督察地方、中央企業和部門有力有序推進立行立改、邊督邊改，力求整改效果與群眾感受相一致，切實提升人民群眾獲得感。
  截至9月10日晚20:00，各督察組共收到群眾來電、來信舉報3809件，受理有效舉報3000件，經梳理合并重復舉報，累計向被督察單位轉辦2731件；被督察單位已完成查處289件，其中立案處罰101家，罰款1243.82萬元；立案偵查5件，拘留3人；約談黨政領導干部58人，問責黨政領導干部21人。